Linux 命令

1 常⻅系统服务命令

常⽤命令	作⽤
chkconfig —list	列出系统服务
service <服务名> status	查看某个服务
service <服务名> start	启动某个服务
service <服务名> stop	终⽌某个服务
service <服务名> restart	重启某个服务
systemctl status <服务名>	查看某个服务
systemctl start <服务名>	启动某个服务
systemctl stop <服务名>	终⽌某个服务
systemctl restart <服务名>	重启某个服务
systemctl enable <服务名>	开启⾃启动
systemctl disable <服务名>	关闭⾃启动

2 权限管理

常⽤命令	作⽤
chmod ugo+rwx dir1	设置⽬录所有者(u)、群组(g)及其他⼈(o)的读（r）写(w)执⾏(x)权限
chmod go-rwx dir1	移除群组(g)与其他⼈(o)对⽬录的读写执⾏权限
chown user1 file1	改变⽂件的所有者属性
chown -R user1 dir1	改变⽬录的所有者属性
chgrp group1 file1	改变⽂件群组
chown user1:group1 file1	改变⽂件的所有⼈和群组

3 用户和用户组

常⽤命令	作⽤
useradd codesheep	创建⽤户
userdel -r codesheep	删除⽤户
usermod -g group_name user_name	修改⽤户的组
usermod -aG group_name user_name	将⽤户添加到组
usermod -s /bin/ksh -d /home/codepig –g dev codesheep	修改⽤户 codesheep 的登录 Shell、主⽬录以及⽤户组
groups test	查看 test ⽤户所在的组
groupadd group_name	创建⽤户组
groupdel group_name	删除⽤户组
groupmod -n new_name old_name	重命名⽤户组
su - user_name	完整切换到⼀个⽤户环境
passwd	修改⼝令
passwd codesheep	修改某⽤户的⼝令
w	查看活动⽤户
id codesheep	查看指定⽤户 codesheep 信息
last	查看⽤户登录⽇志
crontab -l	查看当前⽤户的计划任务
cut -d: -f1 /etc/passwd	查看系统所有⽤户
cut -d: -f1 /etc/group	查看系统所有组

4 其他命令

sudo !!：root 下执行刚刚的命令
sudo su：以 root 形式进入新 shell

5 元字符，通配符及 shell 中的各种扩展

创建 100 个文件夹

mkdir -p dir{1..1000}

shell 扩展有以下几种，并按以下顺序处理，当然如果没找到匹配的扩展格式，那就不处理

brace expansion 大括号({})扩展
tilde expansion ~字符扩展
parameter and variable expansion 参数和变量扩展
arithmetic expansion 算术扩展
command substitution 命令替换
process substitution 过程替换
word splitting
Filename Expansion 通配符扩展

shell 常见通配符不多，如下图：
Linux 命令-1.png

shell 元字符啦，还有一系列其它 shell 元字符，如下表：

Linux 命令-2.png

6 高级目录管理

主要是理解软硬链接，绝对路径和相对路径，环境变量这些概念，以前你在 Windows 或者 MacOS 这样的桌面操作系统里面是接触不到这些概念的，因为那些电脑是需要卖给千家万户，各个阶层的普通人，要足够傻瓜化的操作才符合大众的定位和认知。但是我们生信工程师作为某种程度的专业人士，要学的更深入，看的更远。

比如，你可以在视窗操作系统打开 QQ 或者微信这样的界面版软件，在上面谈天说地，打开网络浏览器畅游知识的海洋，你肯定不会去思考，为什么我点击桌面的 QQ 图表，电脑就自动打开了 QQ 这个软件呢？同样的，你也不会想到，为什么我是 linux 的命令行交互界面输入 ls 就能列出我当前文件夹里面的内容呢？

用type 命令用来显示指定命令的类型，判断给出的指令是内部指令还是外部指令。主要的命令类型：

alias：别名。
keyword：关键字，Shell 保留字。
function：函数，Shell 函数。
builtin：内建命令，Shell 内建命令。
file：文件，磁盘文件，外部命令。
unfound：没有找到。

你会发现很多命令，都存在于下面的目录：

/usr/local/sbin
/usr/local/bin
/usr/sbin
/usr/bin
/sbin
/bin

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这难道是一种巧合吗？当然不是啦，如果你 echo $PATH 就能发现这些目录都是存储在 PATH 这个变量，在 shell 里面的变量需要使用这个美元符合来进行标识。这个 PATH 变量就是我们的环境变量啦，掌握它是 linux 的一个分水岭，我们生物信息学领域大名鼎鼎的 conda 软件，就是通过修改你的环境变量 PATH 值来进行软件管理。

不仅仅是 PATH，linux 系统还预设了大量的变量，大全如下：

$SHELL     默认Shell
$HOME      当前用户家目录
$IFS       内部字段分隔符
$LANG      默认语言
$PATH      默认可执行程序路径
$PWD       当前目录
$UID       当前用户ID
$USER      当前用户
$HISTSIZE  历史命令大小，可通过HISTTIMEFORMAT变量设置命令执行时间
$RANDOM    随机生成一个0至32767的整数
$HOSTNAME  主机名
 
$0：保存当前程序或脚本的名称
$*：保存传递给脚本或进程的所有参数
$$：当前进程给脚本的PID号
$!：后台运行的最后一个进程的PID号
$?：用于返回上一条命令是否成功执行。如果成功执行，将返回数字0，否则返回非零数字（通常情况下都返回数字1）。
$#：用于保存脚本的参数个数

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其实归根结底，是对 shell 的变量这个概念的掌握。

Linux 命令-3.png

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